L’ancienne cathédrale est détruite en 1002, lors d’une guerre qui oppose les partisans du nouvel empereur Henri (dont l’évêque de Strasbourg) et son compétiteur le duc de Souabe.
Après l’incendie de 1176, on décide de reconstruire la nouvelle cathédrale sur les fondations de l’évêque Wernher.
Redevenue française en novembre 1918, annexée au Troisième Reich de 1940 à 1944, l’Alsace souffre des conflits opposant la France et l’Allemagne.
Mais, dès 1949, elle devient le symbole de la construction européenne, avec la fondation à Strasbourg du Conseil de l’Europe puis l’installation du Parlement européen.
En 1956, Le Conseil de l’Europe offre à la Cathédrale le grand vitrail du chœur.